专栏名称: 药学进展
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长链非编码RNA 在食管鳞癌中的功能及临床应用价值(独家原创)

药学进展  · 公众号  · 药品  · 2017-08-16 10:27

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p300 于该位点,诱导 ZEB1 染色体结构舒展,激活 ZEB1 转录。

2.2lncRNA 的反式调控

反式调控是指 lncRNA 与蛋白复合物结合并定位到靶基因上,远距离作用于其他染色体上的基因,这使得 lncRNA 可以像蛋白因子一样,在大范围的基因网络中发挥调控作用。

lncRNA HOTAIR 是在人成纤维细胞的 HOX 基因( homeotic genes )中首次发现的通过反式调控基因表达的 lncRNA HOTAIR 位于 12q13.13 染色体, 由 HOX 基因反义链转录,长度为 2.2 kb 。多项研究发现, HOTAIR ESCC 组织中表达量升高,而且这种表达水平的升高和食管癌远端转移和组织分化显著相关。 Ge 研究发现, HOTAIR ESCC 中可以促进 WIF-1 wnt inhibitory factor-1 )启动子区域的组蛋白 H3K27 的甲基化,抑制 WIF-1 基因的表达,激活 Wnt/β-catenin 通路。

2.3lncRNA 参与基因转录后的选择性剪接

基因转录后会产生 mRNA 前体( pre-mRNA ), pre-mRNA 通过剪接将蛋白质编码区相连,不同的剪接方式产生不同的 mRNA 剪接异构体,最终编码出的蛋白产物也会表现出不同或者是相互拮抗的功能和结构特性, mRNA 的这种转录后加工过程称为选择性剪接。

lincRNA-uc002yug.2 被发现在 ESCC 组织中高表达,且与 ESCC 患者的不良预后相关。研究发现, lincRNA-uc002yug.2 RUNX1 runt-related transcriptionfactor 1 )基因 pre-mRNA 内含子区域有一段 277 nt 的互补序列,可以在转录后水平调控 RUNX1 基因 premRNA 的选择性剪接, 使其产生更多的 RUNX1a CEBPα 基因( CCAAT/enhancer-binding protein-α ) 可以阻断细胞增殖, RUNX1a 存在可以抑制 CEBPα 基因表达, 促进 ESCC 发展。该研究揭示了 lincRNAuc002yug.2 参与 ESCC 发展的重要分子机制,及其成为 ESCC 预后标志物的可能性。

2.4lncRNA 作为ceRNAs 发挥调控作用

miRNA 常常通过识别并结合靶基因转录出的 mRNA ,诱导 mRNA 降解或抑制其翻译过程,在转录或转录后调控靶基因表达。有些 lncRNA 通过与 mRNA 竞争性地结合 miRNA ,调控 mRNA 的水平,这种 lncRNA 被称作竞争性内源 RNA competingendogenous RNAs ceRNA )。

SOX2 基因是一个重要的多功能性调控基因,其基因区与 SOX2OT SOX2 overlapping transcript )的第 3 个内含子序列重合。 Shahryari 发现 SOX2OT 2 个可变剪接体 SOX2OT-S1 SOX2OT-S2 均在 ESCC 表达上调,并通过阻滞细胞周期于亚 G 1 期( sub-G1 ),影响 ESCC 的发生发展。 Shafiee 通过生物信息学分析及实验证明, miR-211 有与 SOX2OT SOX2 转录本互补的序列。 miR-211 可与 SOX2 结合并抑制 SOX2 表达,而 SOX2OT 通过与 SOX2 竞争性结合 miR-211 ,解除 miR-211 SOX2 表达抑制。

Ren 研究发现, HOTAIR 作为 ceRNAs 可以通过与 miR-1 直接结合,下调 miR-1 表达量,解除 miR-1 对靶蛋白细胞周期素 D1 cyclin D1 CCND1 )的抑制作用,从而影响细胞周期,促进 ESCC 细胞增殖。

lncRNA BC032469 被发现在 ESCC 中高表达 ,并与患者淋巴结转移及总生存率降低相关。研究发现 BC032469 可以调控人类端粒逆转录酶 hTERT 基因,过表达 BC032469 上调 hTERT 蛋白水平,促进细胞增殖、迁移及侵袭,从而影响 ESCC 进程。 研究发现, BC032469 序列上存在 miR-1207-5p 结合位点,并通过与其下游靶基因 hTERT 竞争性结合 miR-1207-5p ,进而调控 hTERT 的表达。

2.5lncRNA 间的相互调节作用

肝细胞核因子 1 同源异形框 A- 反义 RNA1 hepatocyte nuclear factor 1 homeoboxA-antisense RNA 1







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