正文
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于该位点,诱导
ZEB1
染色体结构舒展,激活
ZEB1
转录。
2.2lncRNA
的反式调控
反式调控是指
lncRNA
与蛋白复合物结合并定位到靶基因上,远距离作用于其他染色体上的基因,这使得
lncRNA
可以像蛋白因子一样,在大范围的基因网络中发挥调控作用。
lncRNA HOTAIR
是在人成纤维细胞的
HOX
基因(
homeotic genes
)中首次发现的通过反式调控基因表达的
lncRNA
。
HOTAIR
位于
12q13.13
染色体, 由
HOX
基因反义链转录,长度为
2.2 kb
。多项研究发现,
HOTAIR
在
ESCC
组织中表达量升高,而且这种表达水平的升高和食管癌远端转移和组织分化显著相关。
Ge
等
研究发现,
HOTAIR
在
ESCC
中可以促进
WIF-1
(
wnt inhibitory factor-1
)启动子区域的组蛋白
H3K27
的甲基化,抑制
WIF-1
基因的表达,激活
Wnt/β-catenin
通路。
2.3lncRNA
参与基因转录后的选择性剪接
基因转录后会产生
mRNA
前体(
pre-mRNA
),
pre-mRNA
通过剪接将蛋白质编码区相连,不同的剪接方式产生不同的
mRNA
剪接异构体,最终编码出的蛋白产物也会表现出不同或者是相互拮抗的功能和结构特性,
mRNA
的这种转录后加工过程称为选择性剪接。
lincRNA-uc002yug.2
被发现在
ESCC
组织中高表达,且与
ESCC
患者的不良预后相关。研究发现,
lincRNA-uc002yug.2
与
RUNX1
(
runt-related transcriptionfactor 1
)基因
pre-mRNA
内含子区域有一段
277 nt
的互补序列,可以在转录后水平调控
RUNX1
基因
premRNA
的选择性剪接, 使其产生更多的
RUNX1a
。
CEBPα
基因(
CCAAT/enhancer-binding protein-α
) 可以阻断细胞增殖,
RUNX1a
存在可以抑制
CEBPα
基因表达, 促进
ESCC
发展。该研究揭示了
lincRNAuc002yug.2
参与
ESCC
发展的重要分子机制,及其成为
ESCC
预后标志物的可能性。
2.4lncRNA
作为ceRNAs 发挥调控作用
miRNA
常常通过识别并结合靶基因转录出的
mRNA
,诱导
mRNA
降解或抑制其翻译过程,在转录或转录后调控靶基因表达。有些
lncRNA
通过与
mRNA
竞争性地结合
miRNA
,调控
mRNA
的水平,这种
lncRNA
被称作竞争性内源
RNA
(
competingendogenous RNAs
,
ceRNA
)。
SOX2
基因是一个重要的多功能性调控基因,其基因区与
SOX2OT
(
SOX2 overlapping transcript
)的第
3
个内含子序列重合。
Shahryari
等
发现
SOX2OT
的
2
个可变剪接体
SOX2OT-S1
与
SOX2OT-S2
均在
ESCC
中
表达上调,并通过阻滞细胞周期于亚
G
1
期(
sub-G1
),影响
ESCC
的发生发展。
Shafiee
等
通过生物信息学分析及实验证明,
miR-211
有与
SOX2OT
和
SOX2
转录本互补的序列。
miR-211
可与
SOX2
结合并抑制
SOX2
表达,而
SOX2OT
通过与
SOX2
竞争性结合
miR-211
,解除
miR-211
对
SOX2
表达抑制。
Ren
等
研究发现,
HOTAIR
作为
ceRNAs
可以通过与
miR-1
直接结合,下调
miR-1
表达量,解除
miR-1
对靶蛋白细胞周期素
D1
(
cyclin D1
,
CCND1
)的抑制作用,从而影响细胞周期,促进
ESCC
细胞增殖。
lncRNA BC032469
被发现在
ESCC
中高表达 ,并与患者淋巴结转移及总生存率降低相关。研究发现
BC032469
可以调控人类端粒逆转录酶
hTERT
基因,过表达
BC032469
上调
hTERT
蛋白水平,促进细胞增殖、迁移及侵袭,从而影响
ESCC
进程。
Lü
等
研究发现,
BC032469
序列上存在
miR-1207-5p
结合位点,并通过与其下游靶基因
hTERT
竞争性结合
miR-1207-5p
,进而调控
hTERT
的表达。
2.5lncRNA
间的相互调节作用
肝细胞核因子
1
同源异形框
A-
反义
RNA1
(
hepatocyte nuclear factor 1 homeoboxA-antisense RNA 1
,