微生物组-宏基因组分析专题研讨会 (2025.10.18，线下+线上)

主要观点总结

本篇文章介绍了即将开展的一系列培训课程，课程内容涵盖了宏基因组分析的重要性和应用，包括扩增子分析、宏基因组学、单物种转录组学等。课程将提供详细的学习内容和实战演练，帮助学员掌握生物信息学分析技能，成为团队中不可或缺的人才。报名链接和相关课程安排也已提供。

关键观点总结

关键观点1: 课程概览

课程涵盖了扩增子分析、宏基因组学、单物种转录组学等领域，提供专业培训，帮助学员掌握相关技能。

关键观点2: 培训内容

包括线上直播课程、课程内容涉及Linux和R基础、宏基因组分析流程搭建、数据分析图表解读和绘制等。

关键观点3: 课程特色

课程注重实战演练，提供经验丰富的导师指导，教授学员在实际操作中掌握技能。提供完整的分析平台和数据库支持，帮助学员高效完成分析任务。

关键观点4: 课程目标

培养学员成为实验中不可或缺的人才，掌握生物信息学分析技能，提升科研能力。

正文

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、远程登陆、文件传输、 常用命令 （视频）

12

Linux软件安装

Conda安装与配置，宏基因组相关软件安装和数据库下载

13

Win软件安装

git

、R、Rstudio、R包、STAMP、AI等

14

图表解读

常用分析图表在文章中意义和使用场景

15

R基础

发展史、生物学中应用、ggplot2绘图 （视频）

16

可视化

16种图表的数据整理和在线绘制

21

宏基因组简介

发展史、常用技术适用范围、分析思路

22

宏基因组有参质控

FastQC

、 Trimmomatic、 MultiQC]( )、KneadData质控、parallel并行计算

23

物种和功能组成

MetaPhlAn2物种组成、HUMAnN2功能组成、功能关联驱动物种

24

物种和功能差异比较和可视化

GraPhlAn

、 LEfSe 、 STAMP 、 R语言统计

25

发表前准备

图片排版

、 数据释放 、 代码整理(可选)

26

网络绘制

基础

、 igraph 、 Gephi

31

物种注释和可视化

Kraken、Kraken2、GraPhlAn、 Krona 、 microbiomeViz 、metacoder

32

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