专栏名称: 生信宝典
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微生物组-扩增子16S分析和可视化(2025.11)

生信宝典  · 公众号  · 生物  · 2025-06-08 21:00

主要观点总结

本文章主要介绍了一系列关于生物信息学分析,特别是扩增子分析的相关课程和培训活动。内容包括课程简介、课程大纲、教程内容简介、图表解读和绘制、扩增子基础和分析流程、可重复计算和统计绘图、功能预测和机器学习、网络和环境因子分析等方面的知识点。文章旨在帮助生物学家更好地掌握生物信息学分析技能,轻松完成扩增子分析,更专注于生物学现象的挖掘。

关键观点总结

关键观点1: 课程简介和目的

介绍培训课程的目的和背景,旨在响应学员的学习需求,提供一条走进生信大门的捷径,为同行提供扩增子分析实战学习和交流的机会。

关键观点2: 课程内容

涵盖生信基础知识和技巧、图表解读和绘制、扩增子基础和分析流程、可重复计算和统计绘图、功能预测和机器学习、网络和环境因子分析等多个方面的知识点。

关键观点3: 培训特色

课程独创五段式教学,包括集中授课、自行练习、微信群问题答疑、上课视频回看反复练习和后续线上课免费参加等环节,真正实现独立分析大数据。

关键观点4: 培训安排

培训活动在北京进行,报名链接已提供,同时提供了详细的课程安排和主题介绍。

关键观点5: 目标受众

生物学家、生信研究人员、以及对生物信息学分析感兴趣的人群。


正文

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课程大纲

每节课1小时一个主题,理论结合实战,学懂原理,实战操作,全是老司机多年经验和代码的无私分享。下面是课程安排,如11代表第一天第一节课,26代表第二天第六节课,41为两周后的线上集中视频答疑。


编号
主题
简介
01
分析平台搭建
Win10: git 、R、Rstudio、R包、 STAMP AI 等 (开课前 1 天晚上)
02
Linux基础
简介、优势、常用操作、序列处理、 软件安装等 (视频课)
03
R基础
发展史、 生物学中应用 ggplot2绘图 模板 (视频课)
11
扩增子基本流程
基本理论、流程介绍和测试
12
结果可视化
16种图表的解读、数据整理和在线绘制
16
发表级图版制作
Adobe Illustrator制作CNS标准图版 (视频课)
21
扩增子介绍
背景知识
、分析原理、科学问题
22
扩增子分析流程
vsearch
+ usearch跨平台分析流程
23
STAMP统计分析
玩转样本筛选、差异比较和统计图表保存
24
多样性分析
R语言实现多样性、物种组成和差异比较图表
25
QIIME2
Linux平台QIIME2私人定制流程






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