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NAR | 刘冰/李岩/袁帅联合揭示HREX识别系统,解码细菌与噬菌体的温度依赖性分子博弈

BioArt  · 公众号  · 生物  · 2025-06-19 17:51

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研究以 T4 噬菌体编码的外切酶 DexA 为模型,发现其不仅可在不同温度下实现结构转换,还展现出对修饰状态的特异识别功能,构建了从温度感应、构象变化到底物选择的完整功能链条 【4】


具体而言,研究发现 DexA 在低温( 25°C )条件下以四聚体形式存在,偏好识别并降解未修饰的宿主大肠杆菌 DNA ;而在 37°C 的生理温度下则主要以二聚体存在,选择性切割 T4 自身的 5hmC 修饰 DNA 。这一构象转变通过冷冻电镜和晶体结构得以揭示,关键的寡聚界面残基 S87, D90 控制着四聚状态的形成,而 W152 D169 则构成识别 5hmC 修饰的构象钳位模块。在生理周期中, DexA 可先后完成宿主 DNA 降解与噬菌体自身重组 DNA 的处理,提示其在噬菌体生命周期中兼具资源获取与基因组维护的双重功能。


更引人关注的是,研究团队还发现了大肠杆菌自身天然编码的同源酶 EcD ,其结构上更趋近于 DexA 二聚体状态,但功能上却实现 反向利用 ”—— 即在生理温度下识别并切割 5hmC 修饰 DNA 。这意味着宿主可能借助同源分子 反向武装 ,形成针对 T4 等含 5hmC 噬菌体的精准防御。基于此,作者 系统提出 “5hmC 识别外切酶 HREX 系统的概念,强调这类分子不仅具有独特识别 5hmC 的能力,还可能广泛存在于微生物群落中,承担重要的宿主 - 病毒交互职能。


这一机制不仅揭示了噬菌体如何将温度信号转译为分子功能调控,也提示我们:






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