主要观点总结
该文章介绍了食管鳞状细胞癌（ESCC）的研究进展。文章指出ESCC的预后较差，最新的研究成果利用多组学技术揭示了ESCC的分子机制，为预后诊断与治疗干预提供了新的潜在靶点。研究对293例ESCC手术样本进行了基因组、转录组、蛋白质组及磷酸化翻译后修饰组学检测，并关联分析了临床表型。文章还讨论了ESCC的免疫微环境异质性及与淋巴转移的相关机制。
关键观点总结
关键观点1: 食管鳞状细胞癌（ESCC）是一种常见的癌症，全球一半以上病例发生在中国。
ESCC的预后较差，目前治疗方法有限，主要以全身性化疗为主。
关键观点2: 最新研究成果利用多组学技术揭示了ESCC的分子机制，为预后诊断与治疗干预提供了新的潜在靶点。
研究对293例ESCC手术样本进行了基因组、转录组、蛋白质组及磷酸化翻译后修饰组学检测，发现了一些与ESCC发生发展相关的基因和蛋白。
关键观点3: 研究指出了ESCC的免疫微环境异质性，可分为不同亚型，其中高免疫细胞浸润的热肿瘤亚型、低肿瘤细胞浸润的冷肿瘤亚型和T细胞耗竭亚型尤为值得关注。
免疫微环境的解析和亚型分析为理解ESCC的免疫逃逸和免疫治疗提供了新的视角。
关键观点4: 文章讨论了ESCC与淋巴转移的相关机制，指出8号染色体长臂扩增是淋巴结转移人群的显著遗传学特征。
高维度调控网络分析显示，8q扩增导致的下游基因表达上调可能是ESCC淋巴结转移的潜在机制。
正文
本研究对
2
93
例ESCC手术样本进行了基因组-
转录组
-蛋白质组-磷酸化翻译后修饰组学检测，并与临床表型进行了关联分析。结果表明，ESCC中
12q13.13
扩增与高分化ESCC患者不良预后显著相关。基于中心法则原理，筛查定位于
12q13.13
的顺式调控基因，
发现上述区域扩增人群中，
LYN
、
ACSS1
等
蛋白被异常高表达，并
介
导了包括脂肪酸代谢、JAK
-STAT
等通路的异常激活，促进了ESCC肿瘤细胞的增殖与侵袭；同时，1
2
q
13.13
的扩增还导致编码于该段区域的角蛋白基因高表达，导致相应肿瘤呈现出高分化特征。上述过程解释了部分高分化ESCC患者预后较差的潜在分子机制。
对ESCC高频突变基因的筛查中，KMT
2
D
（
H3K4 methyltransferase
）
被发现属于高频突变基因，且突变人群预后相对良好。高维度蛋白调控网络分析表明，KMT
2
D突变后，
其
一系列
下游靶基因
表达下调。蛋白质组
学结果
表明，ESCC中，
KMT
2
D靶基因
蛋白
水平越高，患者预后越差
。进一步的，研究团队比较了肿瘤与癌旁的分子表型，发现
上述靶基因
是ESCC肿瘤细胞特有的分子特征
。
为了进一步阐述ESCC人群的分子异质性，研究团队利用蛋白质组学数据进行了分子分型研究。结果表明，ESCC可被
非监督
划分为3个预后显著不同的亚型，其中预后最差的亚型，其基因层面表现为2号染色体短臂扩增。通过基因调控网络分析，发现2p染色体扩增与RXRA、RXRB转录因子蛋白水平上调显著相关，二者是PPAR信号通路的关键节点分子，后者参与
肿瘤细胞代谢模式
的
转化
。该结果提示
了
ESCC中遗传突变
介
导的
顺式基因调控导致
患者预后不良
的潜在机制
。
淋巴转移是恶性化ESCC的重要特征，为了探究ESCC淋巴转移的潜在机制，研究团队对队列中的淋巴结转移人群和无转移人群进行了对比，同时对部分原发灶样本和配对淋巴结转移
灶进行
了蛋白质组学、磷酸化
修饰组
学解析。结果表明，相比无转移人群，淋巴结转移人群8号染色体长臂扩增是一个显著的遗传学特征。高维度调控网络分析结果显示，8
q扩增导致其编码的
