不想做很深的机制如何冲高分期刊呢？看看这篇“空间转录组+三级淋巴结构TLS+氨基酸代谢+免疫治疗”的...

小张聊科研 · 公众号 · 科研 · 2025-04-09 16:00

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免疫疗法是目前肿瘤治疗的重要手段，但仍有 部分患者对免疫治疗不敏感 ；三级淋巴结构（ TLSs ）是在许多癌症中发现的异位淋巴聚集体， 与免疫治疗效果密切相关 ，但目前仍 不知道 TLS 形成的驱动因素 。

作者团队从这一临床问题和研究现状出发，对 肝癌组织中 TLS 进行了空间转录组检测 ， 发现并区分了 TLS 的不同类型 ，结合 配对的 scRNA-seq 和 snATAC-seq 分析，揭示了 肝癌（ HCC ）通过表观遗传改变上调色氨酸代谢，促进 deviating TLSs 形成从而抑制 TLS 成熟，抑制色氨酸代谢或减少食物摄入能协同改善免疫治疗效果。

1 、通过空间转录组学拆解问题： HCC 预后与 TLS 异质性有关

作者首先 使用空间转录组学（ Stereo-seq ）技术检测了 22 名未经治疗和 7 名接受抗 PD-1 治疗的 HCC 患者的 46 份组织样本 ，利用无监督聚类分析成功识别出 838 个 TLSs ，并利用多重免疫组化（ mIHC ）进行了验证。结果表明 TLSs 在细胞组成和空间组织上表现出高度异质性，基于 naive B 细胞到生发中心 B 细胞（ GC-B ）的分化轨迹，将 TLSs 分为成熟、符合（ conforming ）和偏离（ deviating ）三种类型 。