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新一代的遗传筛查: CIRSPR与单细胞测序的强强联合

生物通  · 公众号  ·  · 2017-06-02 17:11

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Perturb-seq

在《Cell》杂志上发表的两项研究中,加州大学旧金山分校的Jonathan Weissman和Broad研究院的Aviv Regev介绍了一种称为Perturb-seq的新方法。Broad的团队使用这种方法分析了20万个细胞,重点在调控树突状细胞反应的转录因子。Perturb-seq准确鉴定了受扰动影响的单个基因靶点、基因特征和细胞状态。


Weissman实验室的博士后研究员、其中一篇文章的共同第一作者Britt Adamson表示:“Perturb-seq填补了当前功能基因组学研究的一大缺口。它提供了一种革命性的工具,能够快速系统地剖析细胞中所有主要的转录通路。”


这种基于CRISPR-Cas9的方法依赖设计的向导RNA来实现靶向的基因组编辑。据作者介绍,主要的瓶颈在于开发细胞条形码策略,以便准确捕获哪个向导RNA在特定细胞中表达,以及哪个基因被扰动。他们的研究十分了不起,在扩大单细胞数量的同时,还能够将扰动准确分配到每个细胞。








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