COME：区分mRNA 和 lncRNA 的工具

正文

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（缺点），仅部分模式物种可用：人类（hg19），小鼠（mm10），果蝇（dm3），线虫（ce10）和拟南芥（TAIR10），且依赖于特定的基因组版本。这实际上是为了高效利用序列保守信息，表达信息而做出的牺牲。

使用COME

环境要求

Linux R(>=2.15.2) R包（“randomForest”, “rhdf5”）

软件安装与使用

安装

$ wget https://github.com/lulab/COME/archive/master.zip

$ unzip master.zip

$ Bin_dir=`pwd|awk ‘{print $1}’=`

#下载物种的特征向量并将放入 "COME-master/bin/HDF5" 文件夹

#将模型放入 "COME-master/bin/models"

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