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环状RNA中谁才是肝细胞癌的明星标记物?

解螺旋  · 公众号  · 医学  · 2017-07-17 18:06

正文

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1

Circular RNA MTO1 acts as the sponge of miR-9 to suppress hepatocellular carcinoma progression


该文是描述肝细胞癌的肿瘤标记物的精彩文章,文章从结构上分析是完全按照ceRNA的机制分三个阶段验证。


首先是利用芯片分析筛选出环状RNA-circMTO1,进而在肝细胞癌的组织中进一步验证,并且值得一提的是还在预后的病人组织中进行验证。


第二阶段利用MiRanda Program预测可能与其结合的miRNA,并且采用circMTO1探针技术进行RIP实验富集到了预测的miR-9,该小RNA在预测的候选miRNA中。第三阶段,探索miR-9的靶向mRNA-P21,并且采用体内和体外的丰富的实验技术共同验证。


最后作者总结为circMTO1 可能会成为最值得考虑的具有潜在的预后诊断价值以及治疗肝细胞癌的有效药物靶点。


2

Screening differential circular RNA expression profiles reveals hsa_circ_0004018 is associated with hepatocellular carcinoma


通过文章的题目可知作者通过筛选不同的环状RNA的表达水平揭示出hsa_circ_0004018 是与肝细胞癌相关的环状RNA,那就来看看文章是通过什么实验技术筛选和验证的吧?


首先通过circRNA microarray分析到hsa_circ_0004018,并且用qRT-PCR技术验证出hsa_circ_0004018在肝细胞癌的表达水平中显著性降低,接着又进一步证实hsa_circ_0004018与肝细胞癌的临床病理特征的相关性分析,更值得学习的是本文作者还比较了在慢性肝炎、肝硬化和肝细胞癌患者三种肝脏疾病中hsa_circ_0004018的表达水平,用ROC面积曲线展示。


最后作者总结出,hsa_circ_0004018 不仅是肝细胞癌的具有诊断性意义的标记物,而且在肝细胞癌的形成和代谢中发挥着重要作用。









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