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使用 MPI for Python 并行化遗传算法

程序员大咖 · 公众号 · 程序员 · 2017-10-02 10:24

正文

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MPI_INSTALLED :

mpi_comm = MPI . COMM_WORLD

return mpi_comm . Get_size ()

else :

return 1

@ property

def is_master ( self ) :

return self . rank == 0

组内集合通信接口

由于本次并行化的任务是在种群繁衍时候进行的，因此我需要将上一代种群进行划分，划分成多个子部分，然后在每个进程中对划分好的子部分进行选择交叉变异等遗传操作。在最后将每个字部分得到的子种群进行收集合并。为此写了几个划分和收集的接口:

def split_seq ( self , sequence ) :

'''

Split the sequence according to rank and processor number.

'''

starts = [ i for i in range ( 0 , len ( sequence ), len ( sequence ) // self . size )]

ends = starts [ 1 : ] + [ len ( sequence )]

start , end = list ( zip ( starts , ends ))[ self . rank ]

return sequence [ start : end ]

def split_size ( self , size