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先导编辑的逆转录酶参与哺乳动物细胞的DNA损伤修复

自然系列  · 公众号  · 科研  · 2025-02-22 12:40

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基因编辑技术的精准化发展极大推动了生命科学研究,并为遗传病治疗提供了强有力的工具。先导编辑(Prime Editing, PE)作为一种高度灵活的基因编辑策略,无需依赖DNA双链断裂(DSB)或外源供体DNA模板,即可在目标位点实现精确的插入、缺失或碱基替换。相较于CRISPR-Cas9和碱基编辑(Base Editing)技术,PE有效降低了脱靶效应,拓宽了基因编辑在基础研究和临床应用中的潜力。PE的蛋白组分主要由nCas9(nickase Cas9)和逆转录酶(reverse transcriptase, RT)组成。尽管PE在提高编辑精度方面已展现出独特优势,但目前对其逆转录酶是否会影响哺乳动物细胞内源性的DNA损伤修复机制仍缺乏系统研究。

结果与展望
本研究结合活细胞成像、激光微照射(laser microirradiation)及高通量测序等技术,探究逆转录酶在DNA损伤位点的招募,并解析其对内源DNA修复路径选择的影响。
首先,我们利用CRISPR-Cas9在哺乳动物细胞特定位点诱导DNA双链断裂(DSB),并通过扩增子测序(amplicon sequencing)分析逆转录酶在DNA损伤修复过程中的作用。结果表明,逆转录酶的表达显著提高了插入事件的比例,同时降低了缺失和同源重组(HR)修复的发生率,提示其可能影响细胞对不同DNA修复路径的选择。进一步,通过激光微照射实验,我们观察到逆转录酶能够迅速募集至DNA损伤位点,且这一过程不依赖于已知的DNA损伤感应因子。此外,我们发现去除RNase H结构域的紧凑型PE显示较低的DNA修复活性,这可能使其更适合临床应用。

我们的研究揭示了PE及游离的RT在染色体断裂修复中的新功能,并呼吁进一步评估PE及逆转录酶在哺乳动物细胞中的长期影响。这一发现不仅深化了对逆转录酶在DNA修复过程中的机制理解,也为提升PE系统的安全性和编辑精度提供了重要理论依据。







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