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填补家禽研究空白!华大智造平台支撑全球首个鸡参考面板首批成果发布

测序中国  · 公众号  ·  · 2025-04-25 13:39

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01

构建全球首个鸡类参考基因组资源库

本研究构建了全球首个鸡类参考基因组资源库,整合了来自全球多个品种/品系的11,951个鸡基因组样本,涵盖全球主要商品鸡与地方鸡种群,识别了超过48M个SNP以及4.7M个InDel突变,其中新发现突变占比高达67.6%,显著扩展了现有变异数据库的覆盖范围。


02

构建两个高质量子面板

依据群体特征构建了两个高质量子面板:CBP(Commercial Breed Panel):基于10,104只商品鸡的低深度测序数据;CMP(Comprehensive Mix Panel):基于1847个深度测序样本,聚焦地方鸡种与遗传多样性。两者可分别支持商业育种与基础研究应用,提供灵活的参考选择。


03

优越的基因型填充性能

通过系统评估显示:GCRP在8种典型场景下均表现出优越的基因型填充性能,其中CMP面板在6种场景中表现最优,填充准确性显著高于现有发布的鸡参考面板资源(如AGIDB和 SNPAtlas等)。


04

GCRP填充数据有效提升了统计效能







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