EBV主要有2种方式感染细胞，分别是裂解感染和潜伏感染，绝大部分情况下病毒处于潜伏感染状态，不进行复制，这种状态下的EBV仅表达6种核抗原（EBNA1、EBNA2、EBNA3a、EBNA3b、EBNA3c、LP）、3种潜伏膜蛋白（LMP1、LMP2A、LMP2B）和2种小RNA（EBER1和EBER2），这有利于病毒逃避机体免疫监视从而实现终生潜伏感染。根据EBV在不同肿瘤细胞中的表达情况，分为潜伏Ⅰ～Ⅲ型。潜伏Ⅰ型表达EBNA和EBERs，多见于B细胞中，如Burkitt淋巴瘤；潜伏Ⅱ型见于B细胞和上皮细胞中，表达EBNA1、LMP1、LMP2A、LMP2B和EBERs，如鼻咽癌和霍奇金淋巴瘤；Ⅲ型见于B细胞，表达 EBNA1、EBNA2、EBNA3A、EBNA3C、LP、LMP2A、LMP2B和EBERs，多见于移植后的淋巴瘤。EBV相关胃癌中可以检测到EBNA1、EBERs、LMP2A等的表达，而无LMP1的表达，不同于Ⅰ型和Ⅱ型感染，而是介于两者之间的独特类型。
1. LMP2A 致癌机制
潜伏性膜蛋白（latent membrane protein，LMP）是EBV增殖过程表达的膜抗原，包括LMP1、LMP2A和LMP2B。LMP2A是LMP2基因编码的、由497个氨基酸组成的蛋白。LMP2A在近一半的EBVaGC中表达，能够阻止胃癌细胞系中转化生长因子-β诱导的细胞凋亡。除此以外，LMP2A可以激活NF-κB进而上调凋亡抑制基因survivin表达，有效阻断细胞凋亡的发生，也可以同细胞周期调控因子CDK4相结合后发挥其一系列下游抗凋亡的作用。LMP2A另一个可能的功能是激活Notch信号通路导致线粒体分裂—融合周期不平衡，表现为增加裂变期。这种改变和不平衡导致细胞移行增多和上皮向间充质细胞转化（epithelial-to-mesenchymal transition，EMT）标志物的过表达，促进癌细胞的迁徙。另外，LMP2A相关的PI3K/Akt通路在B细胞、淋巴细胞、胃癌和上皮细胞中发挥增强细胞生长和抗凋亡作用。除了上述调节作用外，LMP2A还具有诱导宿主基因组表观遗传变化的独特功能。LMP2A促进STAT3磷酸化，激活DNA甲基转移酶（DNMT），上调的DNMT1通过其启动子区域中CpG岛的甲基化导致PTEN表达的表观遗传沉默。
2. EBERS和EBNA-1
EBV转录2个小RNA，包括EBER1和EBER2。EBERs是潜伏期EBV感染细胞中发现的最丰富的病毒转录物，目前研究显示它们在细胞增殖、抵抗细胞凋亡、产生自分泌生长因子和与宿主蛋白相互作用以增强细胞信号传导方面发挥作用。但目前只有少数研究阐明EBERs在胃癌发生中的作用。
3. BARF1
BamH1 A片段右向ORF（BamH1 A rightward open-reading frame-1 ,BARF1）基因位于EB病毒基因组的BamH1 A区域， BARF1是EBV裂解的早期基因。BARF1几乎在所有的EBVaGC中均能被检测到，其可能通过以下方式参与胃癌发生。BARF1与酪氨酸激酶的集落刺激因子受体（FMS）存在功能同源性。BARF1与FMS争夺配体——巨噬细胞集落刺激因子 (M-CSF)，并形成一种复合物，从而降低了M-CSF与FMS的相互作用，这表明 BARF1在肿瘤中可能发挥免疫调节功能。Chang等研究发现BARF1可能增殖通过上调NF-κB/cyclin D1和下调细胞周期抑制剂 p21 WAF1 刺激EBV感染的胃癌细胞，从而促进 EBV诱导的癌症进展。
综上所述，LMP2A、EBERs及BARF1作为EBV潜伏期重要的基因及蛋白通过不同途径在EBVaGC的进展中起着至关重要的作用。
