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Nature Protocols | 王永成团队再突破!全新snRandom-seq技术开启FFPE...

测序中国  · 公众号  ·  · 2025-05-08 14:58

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在细胞核内,利用 随机引物 寡聚 dT引物 的混合策略,全面捕获 mRNA和非编码RNA。独特的DNA阻断技术有效排除基因组DNA污染,而3'端加A尾处理则为后续建库奠定基础。

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微流控液滴建库

单细胞核与含条形码的微球在液滴中封装,通过延伸反应为每个细胞核赋予唯一标识。最终通过 PCR扩增和测序文库构建,实现高通量单细胞转录组分析。

临床应用潜力

研究团队首次将 snRandom-seq应用于 肺癌 胶质瘤 FFPE样本分析,取得了突破性成果:

肺癌研究

结合成像质谱流式技术,揭示了原发灶与转移灶肿瘤微环境的异质性,发现了特定免疫微环境与免疫治疗响应的关联。

胶质瘤研究

在超过100例临床样本中,鉴定出胶质母细胞瘤的复发亚型特征,并检测到与预后相关的非编码RNA标志物。


技术优势与未来展望







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