文献速递：单细胞RNA测序：洞察宫颈癌放化疗后生物信息变化的新利器

生信人 · 公众号 · 生物 · 2025-05-31 07:06

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1e-g 深入剖析其亚群变化。通过亚聚类分析得到 5 个亚簇（ Epi1-5 ），图 1e 展示其在不同样本中的分布差异。图 1f 和图 1g 分别以柱状图和箱线图呈现 RCT 前后亚簇比例及丰度变化倍数。 Epi2 比例增加、 Epi3 下降，表明不同上皮细胞亚群对 RCT 敏感性不同。这可能与各亚群基因表达特征差异有关，为精准治疗提供潜在靶点。

上皮细胞的免疫激活与恶性特征 ——生物信息学挖掘关键基因与通路

图 2 围绕上皮细胞在 RCT 后的变化展开，重点关注免疫反应和恶性特征相关基因表达。图 2a 火山图和图 2b 小提琴图直观呈现基因表达变化，发现 RCT 后免疫相关基因表达上调，如参与白细胞趋化、淋巴细胞激活和抗原呈递的基因。特别是 MHC-II 基因显著上调，这在图 2d 、 e 中各上皮细胞亚簇有不同体现，部分亚簇（ Epi1 、 Epi4 、 Epi5 ） MHC-II 基因上调明显，而 Epi2/3 相对稳定， Epi2 的 MHC-I 表达下调。这些基因变化，揭示 RCT 对上皮细胞免疫原性的影响。 MHC-II 基因上调利于抗原呈递，增强免疫细胞对肿瘤细胞的识别，但不同亚簇的差异反应提示免疫调节的复杂性。这对免疫治疗有指导意义，如针对不同亚簇的免疫干预策略可能提高治疗效果。从恶性特征看，图 2h 和图 2i 展示细胞周期和非整倍体细胞比例变化。 RCT 后整体肿瘤细胞数量减少，但 Epi2/3 亚簇仍有非整倍体细胞残留，且 Epi2 高表达癌前和促转移标记基因。这些基因变化，为预测肿瘤复发风险提供依据，也为后续研究肿瘤细胞耐药机制提供线索。

髓系细胞的重塑 ——生物信息学解析免疫调节新机制

图 3 聚焦髓系细胞，其在肿瘤免疫中起关键作用。图 3a 的 UMAP 可视化展示 7 个髓系亚簇在 RCT 前后的分布变化，图 3c 和图 3d 以柱状图和箱线图呈现亚簇比例和丰度变化倍数， FCN1_M-MDSC 亚簇比例显著增加。图 3b 热图分析巨噬细胞亚簇 M1 和 M2 标志性基因表达，发现髓系细胞存在功能异质性。 APOE_Mac 亚群高表达 C1Qs 补体基因，可能促进免疫抑制微环境； IFIT2_M-MDSC 亚簇表达促炎基因，具有潜在抗肿瘤作用。 RCT 后，图 3h 小提琴图显示所有髓系细胞亚簇促炎特征增强，图 3i 和图 3j 的 GO 分析表明白细胞迁移和激活相关基因表达增加。揭示 RCT 对髓系细胞免疫调节的复杂影响。 FCN1_M-MDSC 亚簇增加及促炎特征增强，可能改变肿瘤免疫微环境，但髓系细胞内不同亚群的相互作用及对肿瘤发展的综合影响仍需深入研究，这为开发靶向髓系细胞的治疗策略提供方向。