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【未止科技】新研究将改写生物课本:人体细胞的DNA竟然是这样折叠的!

ScienceLondon未止科技  · 公众号  ·  · 2017-07-28 20:28

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为了克服这些难题,寻找到最真实的DNA结构图像,来自美国Salk研究所的Clodagh O’Shea教授开发出了一种名叫 ChromEMT的显微荧光成像技术,能够在不损伤细胞完整性的情况下,对细胞减数分裂期和分裂间期的染色质进行高精度的成像。

这种神奇的技术是如何实现的呢?

O’Shea教授带领团队经过长期的筛选,发现了一种染料: 在光线的操控下,它可以进行催化反应,生成一种金属多聚体,为DNA表明披上一层“金属外衣”。 这些多聚体发出的信号,可以被电子显微镜捕捉到,从而能够使我们看到DNA结构的图像。但是,只有染料还不够,科学家们还需要合适的电镜设备来成像。在电镜专家Mark Ellisman的帮助下,O’Shea教授由开发出了一种类似“X射线断层扫描”的电镜设备,能够全方位调整电子束的角度,从而重新构建出一个完整的DNA三维图像。 结合染色质染料和电镜设备,他们创造出了ChromEMT技术。

一切准备妥当,O’Shea教授马上利用新技术,对两种人类细胞染色质进行了观察:包括染色质较为松散的分裂间隙,以及DNA密度较大的减数分裂时期(染色体在这个时期彻底成型)。

令人惊讶的是,他们并未观察到任何教科书中提到的染色质高阶结构 - 即核小体继续压缩形成的染色质纤维(>30纳米)。

观察结果显示,不论是在分裂间期还是分裂期,这串“核小体珠子”并不会形成任何30nm、120nm或者320nm直径的高阶纤维结构。相反, 它们会形成柔韧的、直径5-24nm的链条。它们能够自由弯曲,包装组合,以形成更高级的压缩形态 - 在分裂间期,它们灵活性更大;而在分裂期,它们就会拥有极高的密度。

这或许表明:基因组的表达差异并不是由高阶的折叠结构决定的,而是靠染色质的包装密度。

借助电镜的3D重构技术,科学家们可以“亲身进入”一个250 nm x 1000 nm x 1000 nm的染色质空间 - 就像玩游戏一样,他们可以用第一人称视角在DNA上“环游”- 这让他们能够分析染色质密度如何影响RNA聚合酶。







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