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eLife|鲁志课题组与其合作者取得泛癌早诊研究新成果

细胞  · 公众号  · 医学  · 2022-07-30 12:00

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2.组织特异性 :很多RNA(包括人源和微生物源)的表达是有组织特异性的,因此,不同肿瘤中特异RNA表达谱的改变可以反映在血浆中。

3.低成本 :针对癌症信号的有效的cfRNA 测序相对于cfDNA及其甲基化测序成本更低,对早筛早诊的普及更有利。

2022年7月11日,清华大学生命学院鲁志团队与北京大学第一医院 王鹏远 团队、南昌大学 徐振江 团队等多家单位的医疗和科研人员合作,在生物医学权威期刊eLife上发表题为“利用血浆中人和微生物来源的无细胞RNA进行癌症类型分类”( Cancer type classification using plasma cell-free RNAs derived from human and microbes )的研究论文,报导了细胞外RNA(cfRNA)在泛癌早期诊断中的应用和前景。

研究发现:利用人类血浆中小 RNA(miRNA) 之外的更长更微量的cfRNA(包括了 mRNA, lncRNA, circRNA 等),通过生物信息学分析和机器学习模型的整合,可以很好地诊断常见五大癌症(结肠癌、胃癌、肝癌、食道癌、肺癌),AUC(曲线下面积)达到0.91(尤其是肝癌可以达到0.95以上)。值得一提的是,本研究特别强调针对早期癌症的研究(65%以上的病例属于早期肿瘤),即使在所有早期病例队列里,诊断AUC仍可以达到0.9,揭示了cfRNA 在癌症早期诊断中的价值。另外,在人源cfRNA基础上,如果结合微生物来源的cfRNA,还可以更加准确地区分癌症组织类型。







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