专栏名称: 生信杂谈
生物信息学;生物信息;计算机辅助药物设计;测序分析;Python;R;机器学习;论文写作;网站制作;LOL;dota2。
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用别人的资源做自己的生信分析——Galaxy生信分析平台

生信杂谈  · 公众号  ·  · 2017-07-13 23:26

正文

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这几天Galaxy在升级,7月18号之后就可以正常使用了。Galaxy可以本地化,但过程比较繁琐。

目前Galaxy平台主要用于 测序数 据的生物信息分析,包括数据上传、数据文本处理、数据格式转换、数据过滤、质量处理、统计分析、序列比对、变异和进化分析、SNP分析等。

例如在RNA-seq中使用hisat2 进行reads map。

  1. 使用邮箱注册并上传原始数据后,在左侧工具栏里直接搜索 “hisat2”:

  2. 单击使用”hisat2”后会在页面中间显示hisat2的参数设置界面。

    并且在页面下面包含对软件的介绍及部分结果展示和说明:







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