正文
由于报道EC起源于无纤毛上皮细胞,因此研究人员对除纤毛上皮细胞以外的其他上皮细胞进行重分群,并发现cluster 6中TOP基因包括报道的致癌基因LCN2、SAA1和TFF3,并且NUMA1、TRAP1和CAMSAP3在cluster 6中均低表达。此外,对无纤毛上皮细胞的GSEA分析显示,p53信号通路在cluster 6中下调,这与TRAP1和CAMSAP3衍生的蛋白质组学数据的GSEA一致。因此,将cluster 6定义为TRAP1 low/CAMSAP3 low 细胞群,而后评估其在TME中的基本特征(图4)。
图4:早期EC预后蛋白的多组学鉴定和揭示亚型的特征
随后利用单细胞数据通过CellChat的细胞间相互作用分析显示,上皮细胞与免疫细胞的相互作用最密切。再将免疫亚群赋予细胞身份,包括T细胞、B细胞、NK细胞和髓系细胞以确定哪些免疫亚群与TRAP1 low/CAMSAP3 low 细胞群密切互作(图5)。
分析发现TRAP1 low/CAMSAP3 low 细胞群与髓系细胞尤其是巨噬细胞之间相互作用强度最高,主要的受体配体包括MIF-CD74/CXCL4、MIF-CD74/CD44(图6)。
图5:不同细胞类型之间细胞间通讯的 CellChat 图
图6:早期EC预后蛋白的多组学鉴定和揭示亚型的特征
2.验证预后蛋白及其在EC患者中预测死亡风险的能力
进一步利用TCGA数据库证实预后蛋白表达与EC之间的相关性,并构建临床预测模型。从TCGA上下载了589例UCEC患者的mRNA测序数据。根据FIGO分期,将患者分为早期组(I-II期,n=395)、晚期组(III-IV期,n=159)和正常人群(n=35)进行差异分析和Kaplan-Meier(K-M)生存分析,发现 TRAP1 和 CAMSAP3 的低表达水平预示着患者预后较差。然后将cBioPortal网站中TP53突变状态的EC患者通过倾向评分匹配(PSM)筛选57例EC死亡患者和110例存活患者进行生存分析可以看到患者的5年生存率迅速下降,提示病情进展迅速,并且根据受试者工作特征(ROC)分析表明TRAP1和CAMSAP3能够预测子宫内膜癌恶性进展的风险(图7)。
图7:预后蛋白的临床验证
3.结论:
TRAP1和CAMSAP3与早期EC患者的预后密切相关,并显著提高了通过IHC检测TP53的疗效。TRAP1 low/ CAMSAP3 low细胞群通过p53信号通路富集并促进癌变。
四、讨论
此项研究运用多组学分析技术(蛋白质组学分析和单细胞测序),揭示了早期子宫内膜癌中特征表型细胞群,这一发现显著深化了我们对该疾病预后的理解。特别地,鉴定到的预后蛋白可能会改善早期子宫内膜癌的精确风险分层。这一突破性进展不仅极大地拓展了我们对子宫内膜癌分子发病机制的认知边界,还为临床领域提供了新的生物标志物,预示着早期子宫内膜癌的诊断精度与治疗策略或将迎来重要革新。
临床问题+蛋白组学分析+单细胞测序
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