正文
理论+上机
第三天
9:30-12:00
转录组测序技术在肿瘤研究中的应用
1.转录组测序理论介绍
2.转录组测序在肿瘤研究中的应用及案例分享
理论
13:30-17:00
1.基因表达量估计及差异表达基因分析
2.基因注释
上机
第四天
9:30-12:00
肿瘤研究中的统计分析
1.肿瘤样本生存分析方法与实践
2.基因组变异与临床数据关联分析
3.基因表达与临床数据关联分析
理论+上机
13:30-17:00
利用肿瘤生物信息数据库进行数据挖掘、文章发表案例
1.NCBI数据库介绍及应用
2.TCGA数据库介绍及应用
3.cosmic数据库介绍及应用
4.利用公共数据库发表文章案例解析
理论+上机
注：参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》，通过审稿的论文将会优先发表。
【
报名费用
】
注册费：4500元/人，包括学费、资料费、上机费。培训期间可免费提供午餐。
【
报名优惠政策
】
1、6.20前报名并缴费的学员每人可减少300元
2、3人以上团体报名每人可减少300元；
3、4+1团报，可免费赠送一个名额
4、上面4种优惠政策不能同时享受，只能享受其中一种。
培训以收到学员培训费为成功报名，培训座位按收到费用先后顺序安排。
培训时间：
2017年7月12日-14日 （报名中）
上午9：30-12:00,下午13:30-17:00.
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日期
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授课题目
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授课内容
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第一天
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科技论文绘图基础知识
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1.
科技论文图表要求与论文投稿中的图片格式修改、高分辨率原图处理、矢量图格式要求等；
2.
绘图基础知识、图文件类型、来源与绘制方法介绍；
3.
常规绘图与实现方法及软件学习；
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生物信息学常用工具及绘图方法
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1.基于Photoshop的高清位图处理、工具使用与修图技术；
2.
运用生物信息常用的工具进行专业绘图及格式转换；
3.学习Mega、BioEdit、WeGO、weblogo等常用生物学专业软件的图表及格式转换
4.利用Pymol蛋白质、核酸等大分子3D结构图制作；
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第二天
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R绘图基础
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1.R语言简介
2.
R语言基本功能及基本语法介绍
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生物统计绘图及R语言实现基础
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1.掌握R的绘图相关命令
2.
学会绘制常见的图表（散点图、条形图、文氏图、饼图、盒形图、频率直方图及热图等的绘制）
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第三天
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生物大分子相互作用及网络分析绘图
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1.生物大分子相互作用与网络图基础知识；
2.
基于String、DIP等数据库的蛋白质相互作用分析与图形可视化；
3.
利用Cytoscape 绘制生物分子交互作用复杂网络图、生物学通路的方法及技术应用；
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矢量图修图基础与技术应用
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1.矢量图处理工具Adobe Illustrator学习与功能应用；
2.学习使用Adobe Illustrator以及其他画图工具对绘制完毕的图片进行修改；
3.PDF文件处理与高清图片处理的快捷方法；
4.
科研论文的组图要求与技术；
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(课程内容以实际授课为准)
注：参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》，通过审稿的论文将会优先发表。
【
报名费用
】
注册费：3500元/人（含听课费、资料费、上机费、午餐，请自带笔记本电脑以备上机实践使用），主办方可协助安排入住酒店，住宿费用自理。
【
报名优惠政策
】
1、
6.20日报名并缴费优惠200元；
2、3人以上团体报名每人可减少300元；
3、4+1团报，可免费赠送一个名额
培训以收到学员培训费为成功报名，培训座位按收到费用先后顺序安排
培训时间： 2017年7月19日-21日（报名中）本次课程时间： 上午：9:30-11:30下午：13:30-17:00
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日期
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授课题目
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授课内容
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第一天
上午
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微生物组学研究的发展和挑战
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1.
微生物组研究的发展历史
2.测序平台介绍
3.基于测序的研究方法
3.1 宏基因组（target sequencing 和全基因组）
3.2 单个微生物de novo测序
4.应用案例分析
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第一天
下午
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target sequencing数据分析
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1.linux常用命令使用和上机操作
2.数据分析过程中的编程简介（perl、R、python等）
3.target sequencing数据分析加上机
3.1质控
3.2去嵌合体
3.3 OTU聚类
3.4 注释
3.5统计分析：（1）α多样性分析；（2）β多样性分析；（3）群落结构及丰度分析；（4）进化分析；（5）差异分析(Lefse)；（6）功能分析(picrust)。
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第二天
全天
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Whole metagenome 和metatranscriptome数据分析
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1.质控
2.拼接组装：SOAPdenovo；MetaVelvet; Meta-IDBA等
3.聚类Binning：TETRA; MetaCluster; Phymm等
4.基因注释：FragGeneScan；MetaGeneMark；MetaGeneAnnotator等
5.功能注释：RAMMCAP；Blast等
6.统计分析：（1）物种分析；（2）功能分析；（3）差异分析；（4）表达分析
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第三天
全天
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微生物de novo测序分析
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1.质控
2.单细胞测序去污染、去嵌合体等
3.拼接组装：SPAdes等
4.基因预测
5.功能注释
6.代谢途径分析
7.进化分析：（1）SNP；（2）插入缺失（3）水平基因转移；
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