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Cell | 5个国家,超126万个单细胞!国际团队绘制首个亚洲人群免疫细胞多样性图谱

测序中国  · 公众号  ·  · 2025-03-29 12:30

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TCR-seq )和基因分型对样本中的外周血单核细胞( PBMC )进行分析, 最终获得了 1,265,624 个高质量的循环免疫细胞,构建了免疫细胞的 scRNA-seq 图谱。 这些细胞可分为 8 种主要免疫细胞类型: B 细胞、 CD34+ 造血干细胞和祖细胞( HSPC )、髓细胞、自然杀伤细胞( NK )、浆细胞、浆细胞样树突状细胞( pDC )、血小板和 T 细胞(图 2 )。

1. 参与者情况、样本处理、试验方案和基因型数据的主成分分析。

在性别、年龄和自我报告种族与细胞类型比例的关系分析中,发现 pDC 比例随着年龄的增长而下降, B 细胞在女性中更丰富, NK 细胞比例在男性中较高 。此外,环境和生活方式等因素也可能导致表型变异,例如新加坡马来西亚裔 B 细胞比例较高,泰国个体的骨髓细胞、单核细胞比例较低,新加坡印度裔个体的 NK 细胞较少,韩国参与者的 T 细胞比例较低。这些差异也得到了独立队列的验证。因此研究团队认为,在确定诊断基线时,考虑患者自我报告种族的因素也很重要。

scRNA-seq 可以高分辨率表征差异细胞群。研究团队利用这一特点发现了比上述 8 个主要 细胞类型分析更细粒度的趋势。 虽然 B 细胞在女性个体中更丰富,但深入分析发现这一趋势并不均匀,以幼稚 B 细胞尤为明显 。此外,与年轻个体相比,年龄≥ 50 岁的个体中 CD8+ T 初始细胞均被耗尽。

2 :年龄、性别和自我报告种族的影响

研究还对三种广泛的细胞群 B 细胞、 pDC 细胞和髓细胞,以及先天淋巴细胞( ILC )、 NK 细胞和 T 细胞进行了更细粒度的细胞特性分析, 发现了罕见的细胞亚型,如 dnT (占所有细胞的 0.04% )、 cDC1 0.04% )和非典型 B35 0.4%







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