我研究的物种没有lncRNA数据库，我该怎么办？

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我们大约需要做以下几步工作：

1，准备样品，准备钱，找公司测序。要想鉴定到足够多的lncRNA，还是选择去核糖体建库 (Ribo-zero)方式比较好，虽然这个比polyA建库要贵上不少，但是测的全（都怪那帮lncRNA不爱长A尾...）。当然这里的测序是指二代测序，要测三代？土豪随意（ps，目前国内的公司三代建库貌似都还只能用polyA）。

2，拿到数据，做转录本的拼接，也就是上图中的从RNA-seq data 到 Transcript models。这里头又因有无参考基因组，可分为两个主要的策略，相关的资料很多，就不展开说了。

3，过滤低质量的转录本（可考虑过滤掉表达值过低的一些转录本）

4，去除已经注释了的编码蛋白的转录本（如果有注释的话）

5，去除长度小于200bp的转录本。

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