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circRNA说:我也能翻译蛋白质,挑战传统认知

解螺旋  · 公众号  · 医学  · 2017-04-14 17:53

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通常线性mRNA翻译蛋白依赖于5’端帽状结构,但在应激情况下,有些mRNA也可不依赖帽结构而通过一个内部核糖体进入位点(internal ribosome entry site,IRES)顺势调控元件从mRNA的中间启动翻译。早期研究曾报道过circRNA存在IRES元件并具有翻译蛋白的功能。而王教授在验证该现象时,却又发现了另一奇怪的现象:对照序列(不含IRES元件)也能进行翻译!



但在经过序列分析和MeRIP-seq后发现,对照序列的起始位点(AUG)附近存在着m6A修饰基序——RRACH序列(R=G or A;H=A,C or U),且相比于线性mRNA,circRNA携带了更多的m6A修饰识别序列;而一旦将这些基序的关键位点进行突变后,GFP翻译活动就会受到严重影响,甚至完全消失。另外,m6A修饰水平的高低也可影响着circRNA的翻译效率。



同时,基于二代测序实验(circRNA-m6A-seq),计算机预测和质谱数据库分析比对,研究者还发现细胞内13% circRNA的确存在m6A修饰且处于多核糖体结合状态,并推测内源性circRNA翻译蛋白可能普遍存在。此外, 基于数据库比对结果,该研究也鉴定出一些由circRNA编码的新肽段。



在深入研究其背后机制时发现, circRNA可通过METTL3/METTL14复合物进行m6A修饰,并通过FTO进行m6A去修饰。 而含有m6A修饰位点的circRNA可通过募集YTHDF3蛋白来招募eIF4G2蛋白和其他翻译起始因子,进而启动蛋白翻译过程。








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