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TCGA数据库中异常表达的肺鳞状细胞癌（LUSC）lncRNA

通过R语言计算每个LncRNA的表达水平。根据计算标准，在LUSC中获得了884个异常表达的lncRNA，包括669个高表达和215个低表达（Fig.1A）。

异常表达的lncRNA进行ROC分析，列出了在ROC曲线下面积（AUC）超过0.95的前75个lncRNAs ，这些lncRNA可能在LUSC的发生中起重要作用，具有LUSC高诊断价值（表1，未列全）。

AUC： Area Under Curve被定义为ROC曲线下的面积，面积值在1.0和0.5之间。ROC曲线下的在AUC>0.5的情况下，AUC越接近于1，说明诊断效果越好。AUC在 0.5～0.7时有较低准确性，AUC在0.7～0.9时有一定准确性，AUC在0.9以上时有较高准确性。

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LUSC中十种异常表达的lncRNA的临床价值

选择前10名异常表达的lncRNA（表2）进一步分析，包括表面活性剂相关1（SFTA1P）、LINC00968、LINC00961、LINC01572、RP1-78O14.1，相邻的非编码发育调节RNA（FENDRR）、LINC01314、LINC01272、GATA6-AS1和MIR3945HG。

LUSC中LINC01572的水平明显高于相对应肿瘤组织。相反，其他9个lncRNA在LUSC组织中均明显下调（Fig.2）。

这10个异常表达的lncRNA显示出具有高诊断价值，将LUSC与非癌性肺组织区分，AUC均大于0.99（Fig.3）。

生存分析显示，SFTA1P、LINC01272、GATA6-AS1、MIR3945HG与LUSC的存活时间显著相关（Fig.4）。

多变量cox分析显示，SFTA1P可能是LUSC的独立预后指标（补充表1）。当关注这10个lncRNA与LUSC进展之间的关系时，有几个lncRNA与LUSC的一些临床数据密切相关（表3，Fig.5）。

特别的，LINC01572和LINC01314的水平可以辨别LUSC患者的早期阶段。从TCGA平台提取FGFR1（成纤维细胞生长因子受体1）的原始数据，FGFR1和10个lncRNA之间存在显著正相关（Fig.6）。

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