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HaMStR鉴定直系同源基因

生信百科  · 公众号  · 医学  · 2017-08-26 09:52

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blastall:ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/executables/release/
genewise:ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/software/unix/wise2/
clustalw2 :http://www.clustal.org/download/current/

这些软件安装过程相对简单,只需要按照说明操作来安装,并将每个软件的可执行程序加入到环境变量中。以blastall为例,下载解压后即可直接执行,执行如下命令就可以加入到环境变量中:(注意将BLASTHOME替换成blastall的实际目录)

export PATH=$PATH:BLASTHOME /bin

需要额外注意的一点是, genewise软件需要设置WISECONFIGDIR变量,可以用如下命令:(注意将$genewise2.2_HOME_PATH替换成实际目录)







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